Вот несколько методов управления проектом с тремя модулями, использующими три разные виртуальные среды:

1. Отдельные виртуальные среды: настройте отдельные виртуальные среды для каждого модуля. Это гарантирует, что каждый модуль имеет собственную изолированную среду с определенными зависимостями и конфигурациями.

2. Диспетчеры виртуальной среды. Используйте менеджеры виртуальной среды, такие как Anaconda или Pipenv, для создания отдельных сред для каждого модуля и управления ими. Эти инструменты упрощают процесс создания и активации виртуальных сред.

3. Контейнеризация. Используйте технологии контейнеризации, такие как Docker, для инкапсуляции каждого модуля и его зависимостей в отдельные контейнеры. Это позволяет легко развертывать модули и управлять ими изолированно.

4. Платформы виртуализации. Используйте платформы виртуализации, такие как VirtualBox или VMware, для создания отдельных виртуальных машин для каждого модуля. Каждая виртуальная машина может иметь собственную виртуальную среду, обеспечивающую изоляцию и независимое управление.

5. Инструменты управления зависимостями: реализуйте инструменты управления зависимостями, такие как npm для JavaScript или Bundler для Ruby, для обработки зависимостей, специфичных для модуля. Эти инструменты позволяют вам указывать и управлять зависимостями, необходимыми для каждого модуля отдельно.