Чтобы использовать Cellpose в коде Python, вы можете использовать следующие методы:

Метод 1: установка Cellpose

1. Убедитесь, что в вашей системе установлен Python.
2. Откройте терминал или командную строку.
3. Используйте следующую команду для установки Cellpose через pip:

   pip install cellpose

Метод 2: импорт Cellpose в Python

1. После установки Cellpose вы можете импортировать его в свой код Python, используя следующую строку:

   import cellpose

Метод 3: загрузка и запуск Cellpose

1. Чтобы использовать Cellpose, вам необходимо предоставить ему изображение для сегментации. Вы можете загрузить изображение, используя различные библиотеки, такие как OpenCV или scikit-image.
2. После загрузки изображения вы можете использовать класс ModelCellpose для запуска сегментации. Вот пример:

   from cellpose import models
   # Load the image (replace 'image_path' with the path to your image)
   image = ...  # Load your image here
   # Create a Cellpose model
   model = models.Cellpose(gpu=False)  # Set `gpu=True` if you have a GPU
   # Run the segmentation
   masks, flows, styles, diams = model.eval(image)

Метод 4: доступ к результатам сегментации

1. После запуска сегментации вы получите доступ к результатам:
   • маски: маски сегментации, представляющие различные объекты на изображении.
   • flows: поля потока, обозначающие границы объектов.
   • styles: метки стилей для объектов.
   • диамы: предполагаемые диаметры объектов.

Вот и все! Теперь у вас есть обзор того, как использовать Cellpose в Python. Не забудьте настроить код в соответствии с вашими конкретными требованиями и данными изображения.