Чтобы удалить файл .envиз истории Git, вы можете использовать несколько методов. Вот несколько подходов с примерами кода:

Метод 1: использование git filter-branch

git filter-branch --force --index-filter \
  "git rm --cached --ignore-unmatch .env" \
  --prune-empty --tag-name-filter cat -- --all

Метод 2: использование git filter-repo

git filter-repo --path .env --invert-paths

Метод 3: использование BFG Repo-Cleaner

bfg --delete-files .env

Метод 4. Использование git rebase

git rebase --exec "git rm --cached .env" --preserve-merges --root

Метод 5: использование git filter-repo(скрипт Python)

import git_filter_repo as fr
def path_filter(blob, tree, callback_state):
    path = blob.path
    if path == b'.env':
        return None
    return blob
fr.RepoFilter(path_filter=path_filter).run()